Фізичний характер – засмічення піском, мулом. Надійна фільтрація, як правило, дозволяє усунути механічні частинки. В кінці сезону крапельну стрічку (трубку) необхідно промити, щоб видалити всі частинки, що накопичилися за період експлуатації. Для цього, на кінцях трубки відкриваються заглушки, і струмом води промивається система до тих пір, поки не піде чиста вода.
Біологічний характер. Якщо для поливу використовувалася вода з відкритих водойм, виникає загроза поширення синьо-зелених та інших водоростей і бактерій, які утворюють слиз, що забиває крапельниці (зелений наліт). Тому на таких системах необхідно проводити хлорування: ввести в поливну воду хлор в концентрації 20 мг/л. Промивання проводиться протягом 30-60 хвилин.
Хімічний характер. Якщо поливна вода жорстка, або протягом сезону для підживлення рослин застосовувалися добрива, що містять солі кальцію і магнію, може відбутися блокування крапельниць цими сольовими залишками (білий наліт). Для видалення цих відкладень використовують кислування. Метою використання кислоти, є зниження рН води до рівня, коли ці хімічні відкладення стають розчинними і можуть бути видалені з системи. Знаючи витрату води в одиницю часу, можна розрахувати необхідну кількість кислоти. Для кислування застосовують технічну азотну, ортофосфорну або хлорну кислоту в концентрації 0.6% за діючою речовиною. Тривалість кислотної іригації 30-60 хв. Дуже ефективний підкисляючий засіб Пекацид. Іригація з Пекацидом в концентрації 0.35-0.5% руйнує існуючий карбонатний осад і очищає систему крапельного зрошення, збільшує терміни експлуатації системи.
Після хлорування та кислування необхідна промивка крапельної системи протягом 30-40 хв чистою водою. В кінці сезону обов'язково провести хлорування і добре промити всю систему, якщо необхідно, промити кислотою.